Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME1P48163 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ME1P48163 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ME1P48163 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms