Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACTR1BP42025 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACTR1BP42025 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms