Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms