Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TSPOP30536 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TSPOP30536 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TSPOP30536 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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