Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms