Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD27P26842 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD27P26842 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD27P26842 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD27P26842 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD27P26842 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD27P26842 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD27P26842 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD27P26842 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms