Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRKCHP24723 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PRKCHP24723 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKCHP24723 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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