Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP5F1P24539 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms