Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR3P22607 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms