Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMNB1P20700 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms