Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CXCL3P19876 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CXCL3P19876 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CXCL3P19876 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CXCL3P19876 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CXCL3P19876 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CXCL3P19876 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CXCL3P19876 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CXCL3P19876 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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