Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TFEBP19484 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms