Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPCAMP16422 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms