Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAV1P15498 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAV1P15498 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAV1P15498 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms