Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXD8P13378 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms