Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RDH16O75452 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH16O75452 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH16O75452 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RDH16O75452 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RDH16O75452 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH16O75452 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RDH16O75452 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms