Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPLO60437 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPLO60437 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPLO60437 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPLO60437 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms