Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FANCAO15360 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FANCAO15360 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCAO15360 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCAO15360 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCAO15360 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FANCAO15360 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FANCAO15360 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCAO15360 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms