Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

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Length 1,565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNMO15061 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNMO15061 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNMO15061 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNMO15061 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNMO15061 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNMO15061 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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