Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBAG9O00559 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms