Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBXN8O00124 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms