Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms