Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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