Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms