Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms