Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E9PBE3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E9PBE3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms