Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms