Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVV-2B6SEH9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVV-2B6SEH9 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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