Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ARID3CA6NKF2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARID3CA6NKF2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms