Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ARL2-SNX15V9GYD0 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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