Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms