Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO3Q9UK99 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO3Q9UK99 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms