Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MBD1Q9UIS9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms