Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EBF1Q9UH73 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms