Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CPNE7Q9UBL6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CPNE7Q9UBL6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms