Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RNF7Q9UBF6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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