Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL42Q9P2K6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms