Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHPF2Q9P2E5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.3 ms