Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHST12Q9NRB3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms