Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPHK2Q9NRA0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPHK2Q9NRA0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms