Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms