Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms