Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COG4Q9H9E3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms