Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms