Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCGF6Q9BYE7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCGF6Q9BYE7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms