Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRRTQ9BXP5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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