Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms