Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms