Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PAGR1Q9BTK6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms