Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SMIM7Q9BQ49 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms